SMP N 3 Bayat menggunakan program pembelajaran kurikulum 2013 dengan menggunakan berbagai fasilatas guna menunjang hasil belajar yang optimal. Adapun fasilitasnya adalah :
Program ini mempunyai peran yang sangat urgen dalam mengembangkan minat dan bakat siswa guna untuk mengali kemampuan dan kemauan siswa, adapun jenis dari program ini adalah:
Program ini bertujuan untuk membentuk karakater siswa yang beriman dan bertaqwa kepada tuhan yang mahaesa, jujur, bertanggung jawab dan berkepribadian luhur. Adapun program ini meliputi: